Die Universitätsmedizin Greifswald erfüllt im Rahmen der Universität Greifswald und im Verbund mit deren anderen
Fakultäten die Aufgaben der Medizinischen Fakultät in Forschung und Lehre. Mit 21 Kliniken/Polikliniken, 19
Instituten und weiteren zentralen Einrichtungen nimmt die Universitätsmedizin Greifswald ihre Aufgaben als
medizinischer Maximalversorger wahr.
Im Institut für Bioinformatik, der Universitätsmedizin Greifswald - Körperschaft des öffentlichen Rechts - ist ab
01.04.2024 zu besetzen:
Doktorand*in
in Vollzeit 65% einer Vollbeschäftigung
befristet für 3 Jahre mit der Option auf Verlängerung
Die Befristung richtet sich nach dem Landeshochschul- und Wissenschaftszeitvertragsgesetz.
Am Institut für Bioinformatik der Universitätsmedizin Greifswald bzw. an der Hochschule Coburg ist eine befristete
Stelle zu dem Thema „Nachweis von Nährstoffbiomarkern für das AI-vermittelte Düngemittelmanagement in der
landwirtschaftlichen Kulturpflanzenproduktion auf dem Feld“ (NAIFM) zu besetzen. Das Projekt NAIFM „Nutrient
biomarker for optimized AI-driven fertilizer management“ umfasst die Analyse von Omics Datensätzen und
Bilddatensätzen sowie der Entwicklung von erklärbaren KI-Modellen. Der Aspekt ist hierbei die Verknüpfung der
heterogenen Datensätze und der Entwicklung geeigneter KI-Modelle zur Extraktion von Biomarkern. Hierbei ist die
Anwendung verschiedener Analysetools und deren Visualisierung und Aufbereitung ein Schwerpunkt.
Ihre Aufgaben:
Analyse von Omics Datensätzen
Analyse von Bild Datensätzen
Implementierung von KI-Modellen mittels PyTorch, Tensorflow2 oder R Alternativen
Anwendung und Erstellung von R und Python Skripten zur Analyse und statistischen Auswertung
Unsere Anforderungen:
Umgang mit Next Generation Sequencing Datensätzen
Übung in der Programmierung mit R und/oder Python
Erfahrung in statistischer Auswertung
Selbständiges Erarbeiten biologischer Hypothesen und Fragestellungen
Erste Erfahrungen mit Maschinellen Lernmethoden
Unser Angebot:
Eine systematische Einarbeitung in ein vielseitiges Tätigkeitsfeld
Die Entgeltzahlung erfolgt nach TV-L Bei Erfüllung der tariflichen Voraussetzungen werden Sie in die
Entgeltgruppe E 13 eingruppiert inklusive betrieblicher Altersvorsorge
Die Hansestadt Greifswald ist eine innovative Universitätsstadt an der Ostseeküste mit hohem
Freizeitwert und vielseitigen Bildungsmöglichkeiten
Vereinbarkeit von Beruf und Familie ist Bestandteil der Personalpolitik: Wir bieten aktive Unterstützung
durch unser Familienbüro z. B. bei der Suche nach Kinderbetreuungsplätzen oder Schulen und
unterstützen bei der Suche nach vorrangig möblierten Wohnungen und Übergangslösungen