Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (Doktorand/in) bei Universitätsklinikum Essen

Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (Doktorand/in) (m/w/d) bei Universitätsklinikum Essen

Universitätsklinikum Essen

EINSATZBEREICH

Institut für Experimentelle Immunologie und Bildgebung – Abteilung für Immundynamik

STELLENART

Wissenschaftliche Stelle

STELLEN-ID

11106

EINTRITT

01.07.2024

UMFANG

Teilzeit; 25,025 (65%)

VERTRAGSART

Befristet

BEFRISTUNG

30.06.2027; gemäß § 2 Abs. 1 WissZeitVG

VERGÜTUNG

EG 13 TV-L

Ihre Aufgaben

Probenvorbereitung und Messung

Komplexe Probenaufarbeitung und Messung im Labor unter S1 und S2 Bedingungen
Kollaborative Anwendung von präklinischen in vivo und in vitro Modellen für multimodales Imaging und Massenspektrometrie
Isolation von Gewebe und Zellen durch Lasermikrodissektion für weiterführende massenspektrometrische Untersuchungen
Etablierung und Messung von multiplex Immunfluoreszenz-Mikroskopie Färbungen und Vorbereitung der histologischen Schnitte für die Massenspektrometrie

Erarbeitung und Auswertung multimodaler Datensätze

Etablierung bioinformatischer Algorithmen zur Co-Registrierung von multi-omics Ansätzen aus massenspektrometrischen- und mikroskopischen Datensätzen
Integrative Beurteilung der Daten mittels Multivariate Analysen, Dimensionalitätsreduktion und "Pathway", "Signaling" und "Enrichment" Analysen
Erarbeitung mathematischer und statistischer Algorithmen zur funktionellen Auswertung von multimodalen Imaging Datensätzen sowie Entwicklung neuer bio-informatischer Analyse-Verfahren auf Grundlage multimodaler Datensätze

Etablierung und Analyse von massenspektrometrischen und mikroskopischen Datensätzen

Automatisierte Analyse massenspektrometrischer und mikroskopischer Datensätze mittels Segmentierungsalgorithmen und KI
Etablierung neuer Algorithmen des maschinellen Lernens, um Muster in massenspektrometrischen und mikroskopischen Datensätzen zu identifizieren und Integration der Forschung in die Verbundprojekte
Entwicklung von Methoden zur "minimalen proteomiischen Probenvorbereitung" für die LC-MS/MS

Einbindung in neuartige "cutting edge" Technologien und Ausbildung von Studierenden

Ihr Profil

Voraussetzungen für die Stellenposition

Naturwissenschaftlicher Abschluss (Master- oder Diplom) in Chemie, Physik, Molekularbiologie, Biomedizin, Biologie oder vergleichbaren Studiengängen
Sie arbeiten selbstständig, eigenverantwortlich und zuverlässig
Sie sind flexibel, engagiert und teamfähig
Sie besitzen sehr gute EDV- und Englischkenntnisse

Wünschenswerte Kenntnisse und Kenntnisse, die im Rahmen der Arbeit ausgebaut werden sollen

Erste Erfahrungen in der Massenspektrometrie, Bioinformatik, Mikroskopie, Systembiologie und Immunologie
Erste Erfahrungen in der Analyse mikroskopischer und massenspektrometrischer Datensätze sowie integrative Analysen über Systembiologie und KI-Algorithmen des maschinellen Lernens
Erste Erfahrungen in den Softwares / Sprachen /Anwendungen, wie z.B. MS-Office, Spektronaut, DIA-NN, Proteome Discoverer, R, Python, Cytoscape, ScilsLab, String, GSEA

Freuen Sie sich auf

Einen sicheren Arbeitsplatz im öffentlichen Dienst des Landes NRW
Faire Bezahlung nach Tarif (TV-L) inkl. Jahressonderzahlung und betrieblicher Zusatzversorgung
30 Tage Urlaub im Kalenderjahr (bei einer 5-Tage-Woche)
Interdisziplinäres Arbeiten mit Kolleginnen und Kollegen aus anderen Fachbereichen
Arbeiten mit moderner Ausstattung und zertifizierten Qualitätsstandards
Familienfreundliche Unternehmenskultur, z. B. Betriebskindertagesstätte, Ferienprogramm für schulpflichtige Kinder, Beratung und Unterstützung durch das MitarbeiterServiceBüro in allen Lebenslagen
Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten, bspw. in der Bildungsakademie des UK Essen
Gesundheitsmanagement, z. B. Betriebliches Eingliederungsmanagement, Impfungen, Förderung von Sportangeboten
Attraktive Zusatzleistungen, bspw. vergünstigtes Kantinenessen, Gemeinschaftsevents, Wohnheimplätze