Wissenschaftlicher Mitarbeiter / Doktorand , Institut für Humangenetik in Lübeck bei UKSH Universitätsklinikum Schleswig Holstein

Der von der DFG geförderte Sonderforschungsbereich (SFB) 1665 "Sexdiversity. Determinanten, Bedeutungen und Implikationen der Geschlechtervielfalt in soziokulturellen, medizinischen und biologischen Kontexten" ist ein transdisziplinärer Verbund von biomedizinischer Forschung, Genetik, Neurowissenschaften, Wissenschaftsforschung, Wissenschaftsgeschichte, Ethik und Sozialwissenschaften. Ziel des SFB ist es, die Diversität des Körpergeschlechts in einem breiten Spektrum von Untersuchungen von der zellulären Ebene bis hin zu Analysen in sozialen, historischen und wissenspolitischen Gefügen zu erforschen.

Das Projekt zielt darauf ab, neue Erkenntnisse zu genetischen Grundlagen der Geschlechtsentwicklung zu definieren und nutzt dafür verschiedene experimentelle Ansätze.

Wir suchen eine Wissenschaftliche Mitarbeiterin / einen Wissenschaftlichen Mitarbeiter / eine Doktorandin / einen Doktoranden für das TeilprojektM04 “Identifizierung neuer struktureller und nicht-kodierender genetischer Varianten bei Varianten der Geschlechtsentwicklung (Differences of Sex Development = DSD)“ unter der Leitung von Prof. Olaf Hiort (Sektion für Pädiatrische Endokrinologie und Diabetologie) und Prof. Martin Kircher (Institut für Humangenetik), Universitätsklinikum Schleswig-Holstein, Campus Lübeck und Universität zu Lübeck.

Kommen Sie in unser Team und unterstützen Sie uns zum 1. April 2024, zunächstbefristet bis zum 31. Dezember 2027.

Das bieten wir Ihnen:

• Eingruppierung bis in die Entgeltgruppe E 13 TV-L, bei Erfüllung der tariflichen Voraussetzungen
• Eine Doktorandenstelle (zurzeit nach DFG-Kriterien mit 65% einer Vollzeitstelle vergütet)
• Teilnahme am strukturierten Ausbildungsprogramm des im SFB integrierten Graduiertenkolleg und die einzigartige Möglichkeit, die eigene Forschung im inter- und transdisziplinären Umfeld des SFB (beispielsweise in Vorträgen, Summer Schools und Retreats) zu diskutieren und zu reflektieren. Für weitere Informationen zum SFB siehe https://www.sfb1665.uni-luebeck.de/
• Einen Arbeitsplatz im Center of Brain, Behavior and Metabolism (CBBM; cbbm.uni-luebeck.de) und im direkt anschließenden Gebäude für Biomedizinische Forschung (BMF), die eine exzellente und hochmoderne Forschungsumgebung bieten
• Das Teilprojekt M04 schreibt insgesamt zwei Promotionsstellen mit unterschiedlichem Schwerpunkt aus: Die vorliegende Ausschreibung widmet sich schwerpunktmäßig der Durchführung von Experimenten mit Massive Parallel Reporter Gene Assays, (beide Personen werden sich in verschiedenen Experimenten zu Vektorkonstruktionen, RT-PCRs, NGS-Library Präparation, etc. sowie der Datenanalyse unterstützen können), die andere Ausschreibung widmet sich im Schwerpunkt der Applikation von neuen Analyse-Pipelines zur Bewertung von humanen DNA-Sequenzen.
• Weitere spannende Benefits des UKSH finden Sie hier: Benefits (uksh.de)

Das erwartet Sie:

• Durchführung von Saturation-Mutagenesis-Hochdurchsatzreporterassays (Massively Parallel Reporter Assays, MPRAs) für ausgewählte regulatorische Elemente relevanter DSD-Gene, um potenzielle Effekte zu kartieren
• Durchführung von Long-Read-Genomsequenzierung an ausgewählten Probanden
• Anwendung innovativer algorithmischer Methoden sowie mit Methoden des maschinellen Lernens / der künstlichen Intelligenz um potenziell ursächliche genetische Varianten priorisieren
• Verschiedenste molekulargenetische und -biologische Experimente (u.a. 3D-Genome-Kartierung mittels Hi-C-Methoden) zur weiteren Charakterisierung von Varianten
• Die PIs repräsentieren eine besondere klinische, molekularbiologische und bioinformatische Expertise, um die Doktorandinnen und Doktoranden in den Projektteilen zu begleiten.

Das bringen Sie mit:

• Einem Masterabschluss in (Molekular-)Biologie und / oder Bioinformatik (einschließlich z.B. Computational Molecular Biology, Mathematik in der Medizin und den Lebenswissenschaften, oder angewandter Informatik).
• Sehr gute (experimentelle) molekularbiologische Kenntnisse sowie Programmier- (z.B. Python, R, bash) und Analyseerfahrungen (z.B. Workflow/Software-Management, Unix und HPC-Umgebungen, Statistik, maschinelles Lernen einschließlich neuronaler Netze) (Bitte in der Bewerbung ausweisen)

Bitte fügen Sie Ihrer Bewerbung ein Motivationsschreiben bei, aus dem hervorgeht warum Sie speziell an einer Mitarbeit in diesem SFB interessiert sind und warum Sie sich in das Projekt von Prof. Hiort und Prof. Kircher einbringen möchten und nennen Sie als Referenzen zwei Hochschullehrerinnen / Hochschullehrer, die im Bedarfsfall kontaktiert werden können. Bei Fragen wenden Sie sich gern an Prof. Olaf Hiort (olaf.hiort@uni-luebeck.de) oder Prof. Martin Kircher (martin.kircher@uni-luebeck.de).