Doktorand_in Projekttitel: Heterologe Expression kryptischer Gencluster zur Entdeckung neuer Antibiotika in Saarbrücken bei Helmholtz Zentrum für Infektionsforschung GmbH

Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH

© HZI/Verena Meier
Doktorand_in (w/m/d) Projekttitel: Heterologe Expression kryptischer Gencluster zur Entdeckung neuer Antibiotika
Kennziffer: 131/2024
Saarbrücken

Forschungsgruppe
Antiinfectiva aus Microbiota
Einstellungszeitpunkt
Zum nächstmöglichen zeitpunkt
Befristung
Zunächst befristet für drei Jahre
Probezeit
6 Monate
Vergütung
Angeglichen an E 13 TVöD Bund (55%)
Bewerbungsfrist
30.10.2024
Die Abteilung MICA unter der Leitung von Prof. Christine Beemelmanns sucht eine_n Doktorand_in

The Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland (HIPS) focusses on identifying and developing new treatment options for infectious diseases with an emphasis on natural product research. Especially researchers in the department of Microbial Natural Products are aiming to identify, investigate and optimize novel natural product based actives, applying diverse approaches and methods mainly from the field of biotechnology, microbiology, molecular biology and biochemistry. HIPS was jointly started in August 2009 by the HZI in Braunschweig and Saarland University on Campus Saarbrücken.

In 2015 HIPS moved into a new 4500 m2 research building in which currently 220 international employees work. HIPS represents the first and only publicly funded extra-university research unit in Germany dedicated to pharmaceutical research. The Institute collaborates with universities and various industries both nationally and internationally.

The research project aims to study cryptic biosynthetic pathways encoded in protective bacterial symbionts. The newly generated knowledge should be transformed into novel natural products with protective (e.g. antibiotic) properties and biochemistry amiable for biotechnological processes.

The PhD project encompasses several key components and tasks:
Genome Mining of Marine Bacterial Genomes and Metagenomics Datasets
Undertaking genome sequencing efforts to explore (meta)genomes.
Evaluation of gene cluster pathways of hybrid character (e.g. PKS-NRPS combinations).

Heterologous Expression of Small Hybrid Gene Clusters:
Design of gene constructs for expression in the host(s) of choice.
Optimizing heterologous expression conditions
Genetic manipulation of gene clusters and monitoring of product scaffolds by e.g. single point mutations, module exchange etc.

Metabolomic Analysis of Heterologous Products:
Utilizing high-resolution mass spectrometry to monitor product production.
Identify products using advanced analytical tools (collaborating with experts).
Aufgaben
Voraussetzungen
Arbeitszeit

Wir bieten:
Moderne Labore und hochmoderne Instrumente
Ein dynamisches und internationales Forschungsumfeld
Umfangreiche Weiterbildungsmöglichkeiten und die Möglichkeit, sich für ein strukturiertes Promotionsprogramm einzuschreiben
Ein einzigartiges Netzwerk exzellenter Partner zur Unterstützung Ihrer Forschungsvorhaben
30 Tage Urlaub (24.12. & 31.12. gelten als vollständig freie Tage)
Eine jährliche Zusatzzahlung (Weihnachtsgeld) analog zu § 20 TVöD
Sozialversicherung inklusive
Flexible Gestaltung von Arbeitszeit und Arbeitsplatz
DO IT-Doktorandeninitiative https://www.helmholtz-hzi.de/de/karriere/do-it-doktorandeninitiative
Willkommensbüro, Familienbüro
Patenprogramm für neue Doktoranden

Schwerbehinderte werden bei gleicher fachlicher Eignung bevorzugt. Das HIPS strebt eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit von Frauen und Männern an. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.

Bewerbung:
Bewerber müssen das Online-Bewerbungsformular hier ausfüllen: https://hzi.opencampus.net/ (Bitte wählen Sie die Stellenausschreibung Nr. 131/2024 aus.)

Kontakt
Prof. Dr. Christine Beemelmanns
Antiinfectiva aus Microbiota
+49 681 98806 5000
E-Mail
Weitere Informationen
Forschungsgruppe
Antiinfectiva aus Microbiota
Standort
HIPS