Deep Learning Engineer Institute of Genomic Statistics and Bioinformatics (IGSB) bei Universitätsklinikum Bonn

Universitätsklinikum Bonn

Im UKB werden pro Jahr etwa 500.000 Patient*innen betreut, es sind ca. 9.000 Mitarbeiter*innen beschäftigt und die Bilanzsumme beträgt 1,6 Mrd. Euro. Neben den über 3.300 Medizin- und Zahnmedizin-Studierenden werden pro Jahr weitere 585 Personen in zahlreichen Gesundheitsberufen ausgebildet. Das UKB steht im Wissenschafts-Ranking sowie in der Focus-Klinikliste auf Platz 1 unter den Universitätsklinika (UK) in NRW und weist den dritthöchsten Case Mix Index (Fallschweregrad) in Deutschland auf.

Wissenschaft und Forschung
Vollzeit
Deep Learning Engineer (m/f/d) Institute of Genomic Statistics and Bioinformatics (IGSB)
ST-10001

The Institute of Genomic Statistics and Bioinformatics (IGSB) at the University Hospital Bonn is developing artificial intelligence (AI) to accelerate the diagnosis of rare genetic diseases. As part of the Bone2Gene project (PI: Dr. B. Javanmardi) funded by the Federal Ministry of Education and Research (BMBF, GO-Bio initial program), we are seeking a strong and highly motivated as a full time position (38,5 h/week)

Deep Learning Engineer (m/f/d)

to work on the development of deep learning models for assisting the diagnosis of genetic bone disorders using X-ray imaging data.

The position is limited due the project to 30.09.2026.

Ihre Aufgaben
Data Collection: Collaborate with our global network of clinicians (in genetics, endocrinology, radiology, etc.) to collect data on various bone diseases
Data Cleaning and Structuring: Develop a database of the collected data
Design and Implement Algorithms: Develop algorithms for automated pre-processing of X-ray images and tabular data
Deep Learning: Employ state-of-the-art deep learning architectures to train object detection and image classification models
Conferences and Publications: Attend conferences for networking and presenting your results, and write scientific papers
Stay Updated: Follow the latest research and developments in AI, data science, and computer vision
Ihr Profil
An excellent graduate degree (preferably a PhD) in Computer Science, Life Science Informatics, Physics, or a related field
Strong proficiency in Python, with proven experience in deep learning frameworks (preferably PyTorch) and CNN-based image classification and object detection
Experience with OpenCV or other computer vision libraries, and version control tools (preferably Git)
Familiarity with cloud platforms (e.g., AWS), Docker, and database management systems
A strong sense of responsibility, capable of working both independently and in a team
Systematic approach to complex problems, with a research mentality, math-oriented mindset, and thorough documentation of results. Eagerness to learn and openness to new explorations

What we offer:
A challenging role in an inspiring team of international experts in computer and data science, and medical genetics, within a forward-looking medical field
Access to state-of-the-art high-performance computing infrastructure
Remuneration in accordance with 100% TV-L E13 (subject to relevant collective agreement and personal requirements), initially limited to two years, with all public service benefits (including supplementary pension and annual special payment)
Company health promotion, and further education and training opportunities
The opportunity to be part of an innovative potential university spin-off
Wir bieten
ZUKUNFTSSICHERER ARBEITGEBER
ZUKUNFTSSICHERER ARBEITGEBER

Am UKB arbeiten Sie an einem Krankenhaus der Zukunft. Mit einer Jahresbilanz von 1,6 Mrd. im Jahre 2023, einem Jahresüberschuss von über 21 Millionen Euro und dem dritthöchsten Case Mix Index in Deutschland ist das UKB glänzend für die Zukunft aufgestellt

BEZAHLUNG NACH TV-L
BEZAHLUNG NACH TV-L

Tarifliche und leistungsgerechte Vergütung nach TV-L / TV-Ä an Universitätskliniken (inkl. Zusatzleistungen wie Jahressonderzahlungen)

PRÄMIEN & SONDERZAHLUNGEN
PRÄMIEN & SONDERZAHLUNGEN

Nach TV-L wird eine Jahressonderzahlung ausgezahlt und es gibt weitere Zusatzentlohungen wie unter anderem das Prämiensystem für die Übernahme von Zusatzaufgaben im Team, für ausgewählte Zusatzqualifikationen, Fachweiterbildungen und bei Festanstellung im Pflege-Pool. Außerdem gibt es die Einspringprämie für kurzfristige Einsätze innerhalb
VORTEILE DES TV-E
VORTEILE DES TV-E

Zusätzliche Leistung zur Entlastung in den TV-E berechtigten Bereichen (Entlastungstage)

FLEXIBLE ARBEITSZEITEN
FLEXIBLE ARBEITSZEITEN

Individuelle Arbeitszeitmodelle, Gleitzeit (bei Bürojobs), Home Office

START MIT SYSTEM
START MIT SYSTEM

Strukturiertes Onboarding, fachspezifische und strukturierte Einarbeitung in einem fachkundigen Team, viele Praxisanleiter*